北京航空航天大学计算机学院1981年设立“计算机应用技术”硕士学位授权点，1995年建立“计算机应用技术”博士学位授权点，1997年建立“计算机科学与技术”一级学科，是我国少数具有一级学科博士、硕士学位授予权的单位之一，2002年“计算机软件与理论”被批准为国家重点学科。

自1999年开始招收“计算机应用技术”工程硕士以来，结合学科建设，依托面向关键技术的软件开发环境国家重点实验室、虚拟现实新技术教育部重点实验室、北京市计算机新技术实验室和北京市网络技术重点实验室，为工程硕士研究生教育创造良好的培养环境和学术氛围，确立了关键技术研究与应用技术开发协调互动、与企业科研开发合作和人才培养紧密结合、高速发展的格局，先后承担了973重大项目、863高科技重点项目、国家自然科学基金重点项目、国防重点课题等一大批国家重点或重大项目，并取得国家自然科学奖、国家科技进步奖、国家科技发明奖以及部委科技成果百余项。在指导教师方面，本工程硕士点导师群体中拥有教授10余名，副教授43名，形成了一支以国内知名教授为核心、以中青年学者为骨干、业务强、水平高、富有创新和开拓精神、团结协作的导师队伍。